В отчетах PERCo-S-20 можно выбирать как расчитывать рабочее время сотрудников: посменно или посуточно.

Выдержка из инструкции к модулю рабочего времени PERCo-S-20

В 1С при стандартном заполнении табеля сотрудником, имеющим график работы с периодом работы переходящим на другие сутки принят посуточный вариант.  

Начиная с версии МУРВ 2.0.10.0 можно выбирать вариант расчета табеля.